袋栽木耳长红毛菌可能是长了链孢霉。如果是少量出现，则不要触碰，尽量避免其孢子飞散，可以用柴油洒在长出袋外部分上将其溶解，并将该袋埋入土中降低温度，木耳菌丝有可能继续生长。
如果大量爆发，建议将严重感染的菌袋火烧或掩埋销毁。搬运过程中尽量避免其孢子飞散，并对培养室及整个生产区喷洒消毒剂并烟雾彻底消毒数次。