畸形菇是平菇生产中较为常见的生理性病害，主要是管理不善造成的。少数是由菌种退化、病虫害侵染所致。根据畸形菇发生原因进行预防。 1、长柄菇。菇柄很长，菌盖很小，分化不正常。发生的原因是原基形成及分化期菇房缺氧，或者没有及时脱袋，子实体在菌袋内捂的，影响了菌盖的正常分化。 防控方法：加强通风换气，使菇房二氧化碳浓度在0.1%以下；及时脱袋，避免捂袋。 2、球形菇。菌盖形成球形或者瘤状形，菇盖不分化，形状不规则。发生原因是菇体发育时长时间温度过低所致。 防控方法：调节菇房温度在平菇生长最低温界限以上，一般在5℃以上，以便促进平菇正常生长发育。 3、拟菜花菇。菇形像菜花，后期有多分枝。发生原因是出菇前或出菇期间二氧化碳浓度过高，或者燃煤释放二氧化硫等有害气体。 防控方法：加强菇房通风换气、排出有害气体。 4、萎缩菇。菇体发育初期正常，在膨大期即泛黄、水肿状等，停止生长，最后变软腐烂。水肿状原因是湿度过大或直接向幼小菇体上喷水所致，菇体组织吸水，影响呼吸代谢而停止生长死亡。防控措施：控制菇房相对湿度在80%～90%，不要向幼小菇体上喷水。有时萎缩菇是由于菌种退化造成的，菌盖不能长大即反卷萎缩。防治方法：选用优良平菇品种。